home/categories/scientific-computing/davila7-claude-code-templates-cli-tool-components-skills-scientific-scanpy-skill-md
scientific-computingresearch

scanpy

Single-cell RNA-seq analysis. Load .h5ad/10X data, QC, normalization, PCA/UMAP/t-SNE, Leiden clustering, marker genes, cell type annotation, trajectory, for scRNA-seq analysis.

davila7
maintainer
davila7
آخر تحديث 1/20/2026
النجوم
17577
التفرعات
1576
quick start

Installation and usage

Single-cell RNA-seq analysis. Load .h5ad/10X data, QC, normalization, PCA/UMAP/t-SNE, Leiden clustering, marker genes, cell type annotation, trajectory, for scRNA-seq analysis.

التثبيت
$ install --globalskills.sh
الاستخدام

بعد التثبيت، يمكنك استخدام هذه المهارة بتشغيل الأمر التالي في الطرفية:

skills use scanpy