home/categories/bioinformatics/gptomics-bioskills-alignment-files-alignment-sorting-skill-md
bioinformaticsresearch

bio-alignment-sorting

Sort alignment files by coordinate or read name using samtools and pysam. Use when preparing BAM files for indexing, variant calling, or paired-end analysis.

GPTomics
maintainer
GPTomics
آخر تحديث 2/13/2026
النجوم
471
التفرعات
81
quick start

Installation and usage

Sort alignment files by coordinate or read name using samtools and pysam. Use when preparing BAM files for indexing, variant calling, or paired-end analysis.

التثبيت
$ install --globalskills.sh
الاستخدام

بعد التثبيت، يمكنك استخدام هذه المهارة بتشغيل الأمر التالي في الطرفية:

skills use bio-alignment-sorting