home/categories/scientific-computing/gptomics-bioskills-single-cell-trajectory-inference-skill-md
scientific-computingresearch

bio-single-cell-trajectory-inference

Infer developmental trajectories and pseudotime from single-cell RNA-seq data using Monocle3, Slingshot, and scVelo for RNA velocity analysis. Use when inferring developmental trajectories or pseudotime.

GPTomics
maintainer
GPTomics
آخر تحديث 2/13/2026
النجوم
471
التفرعات
81
quick start

Installation and usage

Infer developmental trajectories and pseudotime from single-cell RNA-seq data using Monocle3, Slingshot, and scVelo for RNA velocity analysis. Use when inferring developmental trajectories or pseudotime.

التثبيت
$ install --globalskills.sh
الاستخدام

بعد التثبيت، يمكنك استخدام هذه المهارة بتشغيل الأمر التالي في الطرفية:

skills use bio-single-cell-trajectory-inference