home/categories/bioinformatics/gptomics-bioskills-variant-calling-variant-calling-skill-md
bioinformaticsresearch

bio-variant-calling

Call SNPs and indels from aligned reads using bcftools mpileup and call. Use when detecting variants from BAM files or generating VCF from alignments.

GPTomics
maintainer
GPTomics
آخر تحديث 4/6/2026
النجوم
471
التفرعات
81
quick start

Installation and usage

Call SNPs and indels from aligned reads using bcftools mpileup and call. Use when detecting variants from BAM files or generating VCF from alignments.

التثبيت
$ install --globalskills.sh
الاستخدام

بعد التثبيت، يمكنك استخدام هذه المهارة بتشغيل الأمر التالي في الطرفية:

skills use bio-variant-calling