home/categories/media/mdbabumiamssm-llms-universal-life-science-and-clinical-skills-skills-sequence-analysis-alignment-files-alignment-sorting-skill-md
mediacontent-media

bio-alignment-sorting

Sort alignment files by coordinate or read name using samtools and pysam. Use when preparing BAM files for indexing, variant calling, or paired-end analysis.

mdbabumiamssm
maintainer
mdbabumiamssm
آخر تحديث 2/4/2026
النجوم
24
التفرعات
4
quick start

Installation and usage

Sort alignment files by coordinate or read name using samtools and pysam. Use when preparing BAM files for indexing, variant calling, or paired-end analysis.

التثبيت
$ install --globalskills.sh
الاستخدام

بعد التثبيت، يمكنك استخدام هذه المهارة بتشغيل الأمر التالي في الطرفية:

skills use bio-alignment-sorting