home/categories/lab-tools/mdbabumiamssm-llms-universal-life-science-and-clinical-skills-skills-sequence-analysis-alignment-files-duplicate-handling-skill-md
lab-toolsresearch

bio-duplicate-handling

Mark and remove PCR/optical duplicates using samtools fixmate and markdup. Use when preparing alignments for variant calling or when duplicate reads would bias analysis.

mdbabumiamssm
maintainer
mdbabumiamssm
آخر تحديث 2/4/2026
النجوم
24
التفرعات
4
quick start

Installation and usage

Mark and remove PCR/optical duplicates using samtools fixmate and markdup. Use when preparing alignments for variant calling or when duplicate reads would bias analysis.

التثبيت
$ install --globalskills.sh
الاستخدام

بعد التثبيت، يمكنك استخدام هذه المهارة بتشغيل الأمر التالي في الطرفية:

skills use bio-duplicate-handling