home/categories/scientific-computing/oimiragieo-agent-studio-claude-skills-scientific-skills-skills-pysam-skill-md
scientific-computingresearch

pysam

Genomic file toolkit. Read/write SAM/BAM/CRAM alignments, VCF/BCF variants, FASTA/FASTQ sequences, extract regions, calculate coverage, for NGS data processing pipelines.

oimiragieo
maintainer
oimiragieo
آخر تحديث 3/6/2026
النجوم
24
التفرعات
2
quick start

Installation and usage

Genomic file toolkit. Read/write SAM/BAM/CRAM alignments, VCF/BCF variants, FASTA/FASTQ sequences, extract regions, calculate coverage, for NGS data processing pipelines.

التثبيت
$ install --globalskills.sh
الاستخدام

بعد التثبيت، يمكنك استخدام هذه المهارة بتشغيل الأمر التالي في الطرفية:

skills use pysam