home/categories/bioinformatics/freedomintelligence-openclaw-medical-skills-skills-bio-basecalling-skill-md
bioinformaticsresearch

bio-basecalling

Convert raw Nanopore signal data (FAST5/POD5) to nucleotide sequences using Dorado basecaller. Covers model selection, GPU acceleration, modified base detection, and quality filtering. Use when processing raw Nanopore data before alignment. Guppy is deprecated; use Dorado for all new analyses.

FreedomIntelligence
maintainer
FreedomIntelligence
আপডেট হয়েছে 3/10/2026
স্টার
1987
ফর্ক
270
quick start

Installation and usage

Convert raw Nanopore signal data (FAST5/POD5) to nucleotide sequences using Dorado basecaller. Covers model selection, GPU acceleration, modified base detection, and quality filtering. Use when processing raw Nanopore data before alignment. Guppy is deprecated; use Dorado for all new analyses.

ইনস্টলেশন
$ install --globalskills.sh
ব্যবহার

ইনস্টল করার পর, টার্মিনালে নিচের কমান্ড চালিয়ে আপনি এই স্কিল ব্যবহার করতে পারবেন:

skills use bio-basecalling