home/categories/bioinformatics/gptomics-bioskills-alignment-files-bam-statistics-skill-md
bioinformaticsresearch

bio-alignment-files-bam-statistics

Generate alignment statistics using samtools flagstat, stats, depth, and coverage. Use when assessing alignment quality, calculating coverage, or generating QC reports.

GPTomics
maintainer
GPTomics
আপডেট হয়েছে 2/13/2026
স্টার
471
ফর্ক
81
quick start

Installation and usage

Generate alignment statistics using samtools flagstat, stats, depth, and coverage. Use when assessing alignment quality, calculating coverage, or generating QC reports.

ইনস্টলেশন
$ install --globalskills.sh
ব্যবহার

ইনস্টল করার পর, টার্মিনালে নিচের কমান্ড চালিয়ে আপনি এই স্কিল ব্যবহার করতে পারবেন:

skills use bio-alignment-files-bam-statistics