home/categories/scientific-computing/gptomics-bioskills-genome-assembly-contamination-detection-skill-md
scientific-computingresearch
bio-genome-assembly-contamination-detection
Detect contamination and assess genome quality using CheckM, CheckM2, GTDB-Tk, and GUNC for metagenome-assembled genomes and isolate assemblies. Use when checking assemblies for contamination.
maintainer
GPTomics
আপডেট হয়েছে 2/13/2026
স্টার
471
ফর্ক
81
quick start
Installation and usage
Detect contamination and assess genome quality using CheckM, CheckM2, GTDB-Tk, and GUNC for metagenome-assembled genomes and isolate assemblies. Use when checking assemblies for contamination.
ইনস্টলেশন
$ install --globalskills.sh
ব্যবহার
ইনস্টল করার পর, টার্মিনালে নিচের কমান্ড চালিয়ে আপনি এই স্কিল ব্যবহার করতে পারবেন:
skills use bio-genome-assembly-contamination-detection