home/categories/scientific-computing/gptomics-bioskills-microbiome-functional-prediction-skill-md
scientific-computingresearch

bio-microbiome-functional-prediction

Predict metagenome functional content from 16S rRNA marker gene data using PICRUSt2. Infer KEGG, MetaCyc, and EC abundances from ASV tables. Use when functional profiling is needed from 16S data without shotgun metagenomics sequencing.

GPTomics
maintainer
GPTomics
আপডেট হয়েছে 2/13/2026
স্টার
471
ফর্ক
81
quick start

Installation and usage

Predict metagenome functional content from 16S rRNA marker gene data using PICRUSt2. Infer KEGG, MetaCyc, and EC abundances from ASV tables. Use when functional profiling is needed from 16S data without shotgun metagenomics sequencing.

ইনস্টলেশন
$ install --globalskills.sh
ব্যবহার

ইনস্টল করার পর, টার্মিনালে নিচের কমান্ড চালিয়ে আপনি এই স্কিল ব্যবহার করতে পারবেন:

skills use bio-microbiome-functional-prediction