home/categories/bioinformatics/gptomics-bioskills-rna-quantification-featurecounts-counting-skill-md
bioinformaticsresearch
bio-rna-quantification-featurecounts-counting
Count reads per gene from aligned BAM files using Subread featureCounts. Use when processing BAM files from STAR/HISAT2 to generate gene-level counts for DESeq2/edgeR.
maintainer
GPTomics
আপডেট হয়েছে 2/13/2026
স্টার
471
ফর্ক
81
quick start
Installation and usage
Count reads per gene from aligned BAM files using Subread featureCounts. Use when processing BAM files from STAR/HISAT2 to generate gene-level counts for DESeq2/edgeR.
ইনস্টলেশন
$ install --globalskills.sh
ব্যবহার
ইনস্টল করার পর, টার্মিনালে নিচের কমান্ড চালিয়ে আপনি এই স্কিল ব্যবহার করতে পারবেন:
skills use bio-rna-quantification-featurecounts-counting