home/categories/scientific-computing/gptomics-bioskills-single-cell-batch-integration-skill-md
scientific-computingresearch

bio-single-cell-batch-integration

Integrate multiple scRNA-seq samples/batches using Harmony, scVI, Seurat anchors, and fastMNN. Remove technical variation while preserving biological differences. Use when integrating multiple scRNA-seq batches or datasets.

GPTomics
maintainer
GPTomics
আপডেট হয়েছে 2/13/2026
স্টার
471
ফর্ক
81
quick start

Installation and usage

Integrate multiple scRNA-seq samples/batches using Harmony, scVI, Seurat anchors, and fastMNN. Remove technical variation while preserving biological differences. Use when integrating multiple scRNA-seq batches or datasets.

ইনস্টলেশন
$ install --globalskills.sh
ব্যবহার

ইনস্টল করার পর, টার্মিনালে নিচের কমান্ড চালিয়ে আপনি এই স্কিল ব্যবহার করতে পারবেন:

skills use bio-single-cell-batch-integration