home/categories/bioinformatics/gptomics-bioskills-spatial-transcriptomics-spatial-domains-skill-md
bioinformaticsresearch

bio-spatial-transcriptomics-spatial-domains

Identify spatial domains and tissue regions in spatial transcriptomics data using Squidpy and Scanpy. Cluster spots considering both expression and spatial context to define anatomical regions. Use when identifying tissue domains or spatial regions.

GPTomics
maintainer
GPTomics
আপডেট হয়েছে 2/13/2026
স্টার
471
ফর্ক
81
quick start

Installation and usage

Identify spatial domains and tissue regions in spatial transcriptomics data using Squidpy and Scanpy. Cluster spots considering both expression and spatial context to define anatomical regions. Use when identifying tissue domains or spatial regions.

ইনস্টলেশন
$ install --globalskills.sh
ব্যবহার

ইনস্টল করার পর, টার্মিনালে নিচের কমান্ড চালিয়ে আপনি এই স্কিল ব্যবহার করতে পারবেন:

skills use bio-spatial-transcriptomics-spatial-domains