home/categories/bioinformatics/gptomics-bioskills-spatial-transcriptomics-spatial-neighbors-skill-md
bioinformaticsresearch

bio-spatial-transcriptomics-spatial-neighbors

Build spatial neighbor graphs for spatial transcriptomics data using Squidpy. Compute k-nearest neighbors, Delaunay triangulation, and radius-based connectivity for downstream spatial analyses. Use when building spatial neighborhood graphs.

GPTomics
maintainer
GPTomics
আপডেট হয়েছে 2/13/2026
স্টার
471
ফর্ক
81
quick start

Installation and usage

Build spatial neighbor graphs for spatial transcriptomics data using Squidpy. Compute k-nearest neighbors, Delaunay triangulation, and radius-based connectivity for downstream spatial analyses. Use when building spatial neighborhood graphs.

ইনস্টলেশন
$ install --globalskills.sh
ব্যবহার

ইনস্টল করার পর, টার্মিনালে নিচের কমান্ড চালিয়ে আপনি এই স্কিল ব্যবহার করতে পারবেন:

skills use bio-spatial-transcriptomics-spatial-neighbors