home/categories/bioinformatics/gptomics-bioskills-variant-calling-variant-calling-skill-md
bioinformaticsresearch

bio-variant-calling

Call SNPs and indels from aligned reads using bcftools mpileup and call. Use when detecting variants from BAM files or generating VCF from alignments.

GPTomics
maintainer
GPTomics
আপডেট হয়েছে 4/6/2026
স্টার
471
ফর্ক
81
quick start

Installation and usage

Call SNPs and indels from aligned reads using bcftools mpileup and call. Use when detecting variants from BAM files or generating VCF from alignments.

ইনস্টলেশন
$ install --globalskills.sh
ব্যবহার

ইনস্টল করার পর, টার্মিনালে নিচের কমান্ড চালিয়ে আপনি এই স্কিল ব্যবহার করতে পারবেন:

skills use bio-variant-calling