home/categories/bioinformatics/gptomics-bioskills-workflows-metagenomics-pipeline-skill-md
bioinformaticsresearch

bio-workflows-metagenomics-pipeline

End-to-end metagenomics workflow from FASTQ to taxonomic and functional profiles. Covers Kraken2 classification, Bracken abundance estimation, and HUMAnN functional profiling. Use when profiling metagenomic samples.

GPTomics
maintainer
GPTomics
আপডেট হয়েছে ১৩/২/২০২৬
স্টার
471
ফর্ক
81
quick start

Installation and usage

End-to-end metagenomics workflow from FASTQ to taxonomic and functional profiles. Covers Kraken2 classification, Bracken abundance estimation, and HUMAnN functional profiling. Use when profiling metagenomic samples.

ইনস্টলেশন
$ install --globalskills.sh
ব্যবহার

ইনস্টল করার পর, টার্মিনালে নিচের কমান্ড চালিয়ে আপনি এই স্কিল ব্যবহার করতে পারবেন:

skills use bio-workflows-metagenomics-pipeline