home/categories/bioinformatics/k-dense-ai-scientific-agent-skills-scientific-skills-phylogenetics-skill-md
bioinformaticsresearch
phylogenetics
Build and analyze phylogenetic trees using MAFFT (multiple alignment), IQ-TREE 2 (maximum likelihood), and FastTree (fast NJ/ML). Visualize with ETE3 or FigTree. For evolutionary analysis, microbial genomics, viral phylodynamics, protein family analysis, and molecular clock studies.
maintainer
K-Dense-AI
আপডেট হয়েছে 3/3/2026
স্টার
18069
ফর্ক
1997
quick start
Installation and usage
Build and analyze phylogenetic trees using MAFFT (multiple alignment), IQ-TREE 2 (maximum likelihood), and FastTree (fast NJ/ML). Visualize with ETE3 or FigTree. For evolutionary analysis, microbial genomics, viral phylodynamics, protein family analysis, and molecular clock studies.
ইনস্টলেশন
$ install --globalskills.sh
ব্যবহার
ইনস্টল করার পর, টার্মিনালে নিচের কমান্ড চালিয়ে আপনি এই স্কিল ব্যবহার করতে পারবেন:
skills use phylogenetics