home/categories/scientific-computing/lamm-mit-scienceclaw-skills-deeptools-skill-md
scientific-computingresearch

deeptools

NGS analysis toolkit. BAM to bigWig conversion, QC (correlation, PCA, fingerprints), heatmaps/profiles (TSS, peaks), for ChIP-seq, RNA-seq, ATAC-seq visualization.

lamm-mit
maintainer
lamm-mit
আপডেট হয়েছে 3/14/2026
স্টার
156
ফর্ক
35
quick start

Installation and usage

NGS analysis toolkit. BAM to bigWig conversion, QC (correlation, PCA, fingerprints), heatmaps/profiles (TSS, peaks), for ChIP-seq, RNA-seq, ATAC-seq visualization.

ইনস্টলেশন
$ install --globalskills.sh
ব্যবহার

ইনস্টল করার পর, টার্মিনালে নিচের কমান্ড চালিয়ে আপনি এই স্কিল ব্যবহার করতে পারবেন:

skills use deeptools