home/categories/astronomy-physics/mdbabumiamssm-llms-universal-life-science-and-clinical-skills-skills-genomics-spatial-transcriptomics-bioskills-image-analysis-skill-md
astronomy-physicsresearch
bio-spatial-transcriptomics-image-analysis
Process and analyze tissue images from spatial transcriptomics data using Squidpy. Extract image features, segment cells/nuclei, and compute morphological features from H&E or IF images. Use when processing tissue images for spatial transcriptomics.
maintainer
mdbabumiamssm
আপডেট হয়েছে 2/4/2026
স্টার
24
ফর্ক
4
quick start
Installation and usage
Process and analyze tissue images from spatial transcriptomics data using Squidpy. Extract image features, segment cells/nuclei, and compute morphological features from H&E or IF images. Use when processing tissue images for spatial transcriptomics.
ইনস্টলেশন
$ install --globalskills.sh
ব্যবহার
ইনস্টল করার পর, টার্মিনালে নিচের কমান্ড চালিয়ে আপনি এই স্কিল ব্যবহার করতে পারবেন:
skills use bio-spatial-transcriptomics-image-analysis