home/categories/scientific-computing/mdbabumiamssm-llms-universal-life-science-and-clinical-skills-skills-sequence-analysis-alignment-files-alignment-indexing-skill-md
scientific-computingresearch

bio-alignment-indexing

Create and use BAI/CSI indices for BAM/CRAM files using samtools and pysam. Use when enabling random access to alignment files or fetching specific genomic regions.

mdbabumiamssm
maintainer
mdbabumiamssm
আপডেট হয়েছে 2/4/2026
স্টার
24
ফর্ক
4
quick start

Installation and usage

Create and use BAI/CSI indices for BAM/CRAM files using samtools and pysam. Use when enabling random access to alignment files or fetching specific genomic regions.

ইনস্টলেশন
$ install --globalskills.sh
ব্যবহার

ইনস্টল করার পর, টার্মিনালে নিচের কমান্ড চালিয়ে আপনি এই স্কিল ব্যবহার করতে পারবেন:

skills use bio-alignment-indexing