home/categories/scientific-computing/pwwang-immunopipe-skills-scfgsea-skill-md
scientific-computingresearch

scfgsea

Performs fast Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) on single-cell data using fgsea R package. Identifies enriched biological pathways by ranking genes based on differential expression between cell groups. Generates enrichment scores, significance metrics, and publication-ready visualizations.

pwwang
maintainer
pwwang
আপডেট হয়েছে 1/20/2026
স্টার
21
ফর্ক
4
quick start

Installation and usage

Performs fast Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) on single-cell data using fgsea R package. Identifies enriched biological pathways by ranking genes based on differential expression between cell groups. Generates enrichment scores, significance metrics, and publication-ready visualizations.

ইনস্টলেশন
$ install --globalskills.sh
ব্যবহার

ইনস্টল করার পর, টার্মিনালে নিচের কমান্ড চালিয়ে আপনি এই স্কিল ব্যবহার করতে পারবেন:

skills use scfgsea