bio-alignment-indexing

Name: bio-alignment-indexing
Author: GPTomics

Create and use BAI/CSI indices for BAM/CRAM files using samtools and pysam. Use when enabling random access to alignment files or fetching specific genomic regions.

Voir le code source bioinformatics

maintainer

GPTomics

Mis à jour 2/13/2026

Étoiles

471

Forks

quick start

Installation and usage

Create and use BAI/CSI indices for BAM/CRAM files using samtools and pysam. Use when enabling random access to alignment files or fetching specific genomic regions.

Installation

$ install --globalskills.sh

Utilisation

Après l'installation, vous pouvez utiliser ce skill en exécutant la commande suivante dans votre terminal :

skills use bio-alignment-indexing