home/categories/bioinformatics/gptomics-bioskills-alignment-files-bam-statistics-skill-md
bioinformaticsresearch

bio-alignment-files-bam-statistics

Generate alignment statistics using samtools flagstat, stats, depth, and coverage. Use when assessing alignment quality, calculating coverage, or generating QC reports.

GPTomics
maintainer
GPTomics
अपडेट किया गया 2/13/2026
स्टार
471
फोर्क
81
quick start

Installation and usage

Generate alignment statistics using samtools flagstat, stats, depth, and coverage. Use when assessing alignment quality, calculating coverage, or generating QC reports.

इंस्टॉलेशन
$ install --globalskills.sh
उपयोग

इंस्टॉल करने के बाद, आप टर्मिनल में यह कमांड चलाकर इस स्किल का उपयोग कर सकते हैं:

skills use bio-alignment-files-bam-statistics