home/categories/bioinformatics/gptomics-bioskills-variant-calling-variant-calling-skill-md
bioinformaticsresearch

bio-variant-calling

Call SNPs and indels from aligned reads using bcftools mpileup and call. Use when detecting variants from BAM files or generating VCF from alignments.

GPTomics
maintainer
GPTomics
अपडेट किया गया 4/6/2026
स्टार
471
फोर्क
81
quick start

Installation and usage

Call SNPs and indels from aligned reads using bcftools mpileup and call. Use when detecting variants from BAM files or generating VCF from alignments.

इंस्टॉलेशन
$ install --globalskills.sh
उपयोग

इंस्टॉल करने के बाद, आप टर्मिनल में यह कमांड चलाकर इस स्किल का उपयोग कर सकते हैं:

skills use bio-variant-calling