home/categories/bioinformatics/gptomics-bioskills-variant-calling-vcf-statistics-skill-md
bioinformaticsresearch

bio-vcf-statistics

Generate variant statistics, sample concordance, and quality metrics using bcftools stats and gtcheck. Use when evaluating variant quality, comparing samples, or summarizing VCF contents.

GPTomics
maintainer
GPTomics
अपडेट किया गया 4/6/2026
स्टार
471
फोर्क
81
quick start

Installation and usage

Generate variant statistics, sample concordance, and quality metrics using bcftools stats and gtcheck. Use when evaluating variant quality, comparing samples, or summarizing VCF contents.

इंस्टॉलेशन
$ install --globalskills.sh
उपयोग

इंस्टॉल करने के बाद, आप टर्मिनल में यह कमांड चलाकर इस स्किल का उपयोग कर सकते हैं:

skills use bio-vcf-statistics