home/categories/lab-tools/mdbabumiamssm-llms-universal-life-science-and-clinical-skills-skills-sequence-analysis-alignment-files-duplicate-handling-skill-md
lab-toolsresearch
bio-duplicate-handling
Mark and remove PCR/optical duplicates using samtools fixmate and markdup. Use when preparing alignments for variant calling or when duplicate reads would bias analysis.
maintainer
mdbabumiamssm
अपडेट किया गया 2/4/2026
स्टार
24
फोर्क
4
quick start
Installation and usage
Mark and remove PCR/optical duplicates using samtools fixmate and markdup. Use when preparing alignments for variant calling or when duplicate reads would bias analysis.
इंस्टॉलेशन
$ install --globalskills.sh
उपयोग
इंस्टॉल करने के बाद, आप टर्मिनल में यह कमांड चलाकर इस स्किल का उपयोग कर सकते हैं:
skills use bio-duplicate-handling