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bio-alignment-sorting

Sort alignment files by coordinate or read name using samtools and pysam. Use when preparing BAM files for indexing, variant calling, or paired-end analysis.

GPTomics
maintainer
GPTomics
更新日 2/13/2026
スター
471
フォーク
81
quick start

Installation and usage

Sort alignment files by coordinate or read name using samtools and pysam. Use when preparing BAM files for indexing, variant calling, or paired-end analysis.

インストール
$ install --globalskills.sh
使い方

インストール後、ターミナルで以下のコマンドを実行してこのスキルを使用できます:

skills use bio-alignment-sorting