home/categories/bioinformatics/gptomics-bioskills-alignment-files-bam-statistics-skill-md
bioinformaticsresearch

bio-alignment-files-bam-statistics

Generate alignment statistics using samtools flagstat, stats, depth, and coverage. Use when assessing alignment quality, calculating coverage, or generating QC reports.

GPTomics
maintainer
GPTomics
更新日 2/13/2026
スター
471
フォーク
81
quick start

Installation and usage

Generate alignment statistics using samtools flagstat, stats, depth, and coverage. Use when assessing alignment quality, calculating coverage, or generating QC reports.

インストール
$ install --globalskills.sh
使い方

インストール後、ターミナルで以下のコマンドを実行してこのスキルを使用できます:

skills use bio-alignment-files-bam-statistics