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bio-duplicate-handling

Mark and remove PCR/optical duplicates using samtools fixmate and markdup. Use when preparing alignments for variant calling or when duplicate reads would bias analysis.

mdbabumiamssm
maintainer
mdbabumiamssm
更新日 2/4/2026
スター
24
フォーク
4
quick start

Installation and usage

Mark and remove PCR/optical duplicates using samtools fixmate and markdup. Use when preparing alignments for variant calling or when duplicate reads would bias analysis.

インストール
$ install --globalskills.sh
使い方

インストール後、ターミナルで以下のコマンドを実行してこのスキルを使用できます:

skills use bio-duplicate-handling