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tcga-bulk-data-preprocessing-with-omicverse
TCGA bulk RNA-seq preprocessing with pyTCGA: GDC sample sheets, expression archives, clinical metadata, Kaplan-Meier survival analysis, and annotated AnnData export.
maintainer
Starlitnightly
更新日 3/9/2026
スター
943
フォーク
116
quick start
Installation and usage
TCGA bulk RNA-seq preprocessing with pyTCGA: GDC sample sheets, expression archives, clinical metadata, Kaplan-Meier survival analysis, and annotated AnnData export.
インストール
$ install --globalskills.sh
使い方
インストール後、ターミナルで以下のコマンドを実行してこのスキルを使用できます:
skills use tcga-bulk-data-preprocessing-with-omicverse