home/categories/bioinformatics/gptomics-bioskills-alignment-files-alignment-sorting-skill-md
bioinformaticsresearch

bio-alignment-sorting

Sort alignment files by coordinate or read name using samtools and pysam. Use when preparing BAM files for indexing, variant calling, or paired-end analysis.

GPTomics
maintainer
GPTomics
Обновлено 2/13/2026
Звёзды
471
Форки
81
quick start

Installation and usage

Sort alignment files by coordinate or read name using samtools and pysam. Use when preparing BAM files for indexing, variant calling, or paired-end analysis.

Установка
$ install --globalskills.sh
Использование

После установки вы можете использовать этот skill, выполнив следующую команду в терминале:

skills use bio-alignment-sorting