bio-variant-calling

Name: bio-variant-calling
Author: GPTomics

Call SNPs and indels from aligned reads using bcftools mpileup and call. Use when detecting variants from BAM files or generating VCF from alignments.

Посмотреть исходный код bioinformatics

maintainer

GPTomics

Обновлено 4/6/2026

Звёзды

471

Форки

quick start

Installation and usage

Call SNPs and indels from aligned reads using bcftools mpileup and call. Use when detecting variants from BAM files or generating VCF from alignments.

Установка

$ install --globalskills.sh

Использование

После установки вы можете использовать этот skill, выполнив следующую команду в терминале:

skills use bio-variant-calling