home/categories/media/mdbabumiamssm-llms-universal-life-science-and-clinical-skills-skills-sequence-analysis-alignment-files-alignment-sorting-skill-md
mediacontent-media
bio-alignment-sorting
Sort alignment files by coordinate or read name using samtools and pysam. Use when preparing BAM files for indexing, variant calling, or paired-end analysis.
maintainer
mdbabumiamssm
Обновлено 2/4/2026
Звёзды
24
Форки
4
quick start
Installation and usage
Sort alignment files by coordinate or read name using samtools and pysam. Use when preparing BAM files for indexing, variant calling, or paired-end analysis.
Установка
$ install --globalskills.sh
Использование
После установки вы можете использовать этот skill, выполнив следующую команду в терминале:
skills use bio-alignment-sorting