home/categories/lab-tools/mdbabumiamssm-llms-universal-life-science-and-clinical-skills-skills-sequence-analysis-alignment-files-duplicate-handling-skill-md
lab-toolsresearch
bio-duplicate-handling
Mark and remove PCR/optical duplicates using samtools fixmate and markdup. Use when preparing alignments for variant calling or when duplicate reads would bias analysis.
maintainer
mdbabumiamssm
Обновлено 2/4/2026
Звёзды
24
Форки
4
quick start
Installation and usage
Mark and remove PCR/optical duplicates using samtools fixmate and markdup. Use when preparing alignments for variant calling or when duplicate reads would bias analysis.
Установка
$ install --globalskills.sh
Использование
После установки вы можете использовать этот skill, выполнив следующую команду в терминале:
skills use bio-duplicate-handling