home/categories/scientific-computing/davila7-claude-code-templates-cli-tool-components-skills-scientific-scanpy-skill-md
scientific-computingresearch
scanpy
Single-cell RNA-seq analysis. Load .h5ad/10X data, QC, normalization, PCA/UMAP/t-SNE, Leiden clustering, marker genes, cell type annotation, trajectory, for scRNA-seq analysis.
maintainer
davila7
اپ ڈیٹ ہوا 1/20/2026
اسٹارز
17577
فورکس
1576
quick start
Installation and usage
Single-cell RNA-seq analysis. Load .h5ad/10X data, QC, normalization, PCA/UMAP/t-SNE, Leiden clustering, marker genes, cell type annotation, trajectory, for scRNA-seq analysis.
انسٹالیشن
$ install --globalskills.sh
استعمال
انسٹال کرنے کے بعد، آپ یہ اسکل ٹرمینل میں درج ذیل کمانڈ چلا کر استعمال کر سکتے ہیں:
skills use scanpy