home/categories/bioinformatics/gptomics-bioskills-alignment-files-alignment-indexing-skill-md
bioinformaticsresearch

bio-alignment-indexing

Create and use BAI/CSI indices for BAM/CRAM files using samtools and pysam. Use when enabling random access to alignment files or fetching specific genomic regions.

GPTomics
maintainer
GPTomics
اپ ڈیٹ ہوا 2/13/2026
اسٹارز
471
فورکس
81
quick start

Installation and usage

Create and use BAI/CSI indices for BAM/CRAM files using samtools and pysam. Use when enabling random access to alignment files or fetching specific genomic regions.

انسٹالیشن
$ install --globalskills.sh
استعمال

انسٹال کرنے کے بعد، آپ یہ اسکل ٹرمینل میں درج ذیل کمانڈ چلا کر استعمال کر سکتے ہیں:

skills use bio-alignment-indexing