home/categories/scientific-computing/mdbabumiamssm-llms-universal-life-science-and-clinical-skills-skills-sequence-analysis-alignment-files-alignment-indexing-skill-md
scientific-computingresearch
bio-alignment-indexing
Create and use BAI/CSI indices for BAM/CRAM files using samtools and pysam. Use when enabling random access to alignment files or fetching specific genomic regions.
maintainer
mdbabumiamssm
اپ ڈیٹ ہوا 2/4/2026
اسٹارز
24
فورکس
4
quick start
Installation and usage
Create and use BAI/CSI indices for BAM/CRAM files using samtools and pysam. Use when enabling random access to alignment files or fetching specific genomic regions.
انسٹالیشن
$ install --globalskills.sh
استعمال
انسٹال کرنے کے بعد، آپ یہ اسکل ٹرمینل میں درج ذیل کمانڈ چلا کر استعمال کر سکتے ہیں:
skills use bio-alignment-indexing